Сюжет четвертого сезона сериала «Звездные войны: войны клонов» начинает разворачиваться в момент, когда неимоверно огромное войско дроидов, разделившись на несколько частей, принимается штурмовать дворец сразу в нескольких направлениях. Падме Амидала блестяще осознает всю серьезность сложившейся ситуации, понимая, что в данном случае ей могут помочь лишь бравые и могучие рыцари-джедаи. Именно эти воины, уже долгое время борющиеся на стороне добра, смогут дать достойный отпор злосчастным темным силам, предводителем которых является коварный и властолюбивый император Палпатин. Сейчас этот беспощадный и жестокий владыка ситхов намеревается претворить в жизнь свой новый злобный план, в случае успешного проворачивания которого он не просто разгромит силы добра и выиграет эту долголетнюю войну, но и после всего этого станет межгалактическим императором, которого все кланы и планеты будут уважать и одновременно бояться.
Вскоре военные действия охватывают немыслимо огромный масштаб, дойдя уже даже до подводного мира. В частности, ввиду ряда обстоятельств, сейчас между гунганами царит сильная напряженность, которая имеет все шансы очень быстро перерасти в сокрушительную гражданскую войну. Представляя возможные необратимые последствия назревающего конфликта, Амидала и Скайуокер принимают решение немедля встретиться с Мон Каламари, а также куарренами в целом. Сенатор и джедай готовы пойти на все, чтобы суметь ослабить напряженность в данном регионе и пресечь нарастающий военный конфликт. Не в лучшем состоянии оказывается планета Алин, жители которой сейчас, как никогда, нуждаются в поддержке. Дело в том, что планета уже немалое время, как страдает из-за сильных землетрясений, которые, по имеющимся прогнозам, еще долго будут сотрясать местных жителей. Поэтому R2-D2 и C-3PO решают объединить свои силы и вместе с одним из клонов отправиться на Алин, попробовав помочь пострадавшей части ее населения. Применив множество усилий, Амидале, Оби-Вану и Скайуокеру удается найти общий язык с гунганами. Но впереди их поджидает новая, не менее ответственная миссия, ввиду чего они отправляются на планету Кир, население которой с недавних пор попало в рабство к расе из планеты Зайгеррия. В это же время шпионы Конфедерации планируют организовать похищение чересчур самоуверенного Палпатина, о чем вскоре также осведомляются джедаи.